data_D2W
# 
_chem_comp.id                                    D2W 
_chem_comp.name                                  "4-[2-(dimethylamino)ethoxy]-~{N}-[[(3~{R})-5-(6-methoxypyridin-2-yl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]benzamide" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C26 H29 N3 O5" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2017-12-15 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2018-08-31 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        463.526 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     D2W 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        6FA2 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  EBI 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
D2W O14 O1  O 0 1 N N N 78.155 98.613  17.522 -0.251 -3.790 1.265  O14 D2W 1  
D2W C13 C1  C 0 1 N N N 77.603 97.597  17.865 -0.372 -2.820 0.543  C13 D2W 2  
D2W C15 C2  C 0 1 Y N N 78.301 96.302  17.638 -1.714 -2.279 0.251  C15 D2W 3  
D2W C28 C3  C 0 1 Y N N 79.321 95.919  18.495 -2.847 -2.882 0.805  C28 D2W 4  
D2W C27 C4  C 0 1 Y N N 79.965 94.709  18.271 -4.098 -2.374 0.531  C27 D2W 5  
D2W C26 C5  C 0 1 Y N N 79.604 93.897  17.194 -4.234 -1.264 -0.294 C26 D2W 6  
D2W O29 O2  O 0 1 N N N 80.151 92.679  16.955 -5.468 -0.767 -0.561 O29 D2W 7  
D2W C30 C6  C 0 1 N N N 79.261 91.600  17.314 -5.536 0.375  -1.417 C30 D2W 8  
D2W C31 C7  C 0 1 N N N 79.878 90.448  18.095 -6.997 0.789  -1.601 C31 D2W 9  
D2W N32 N1  N 0 1 N N N 81.277 90.681  18.514 -7.546 1.235  -0.313 N32 D2W 10 
D2W C34 C8  C 0 1 N N N 81.340 91.702  19.584 -6.888 2.468  0.140  C34 D2W 11 
D2W C33 C9  C 0 1 N N N 82.224 90.944  17.396 -9.001 1.414  -0.395 C33 D2W 12 
D2W C25 C10 C 0 1 Y N N 78.577 94.281  16.351 -3.109 -0.662 -0.847 C25 D2W 13 
D2W C24 C11 C 0 1 Y N N 77.941 95.491  16.566 -1.855 -1.161 -0.574 C24 D2W 14 
D2W N12 N2  N 0 1 N N N 76.458 97.662  18.404 0.720  -2.234 0.012  N12 D2W 15 
D2W C11 C12 C 0 1 N N N 75.479 96.710  18.927 2.053  -2.767 0.306  C11 D2W 16 
D2W C9  C13 C 0 1 N N R 74.253 96.613  17.970 3.098  -2.003 -0.509 C9  D2W 17 
D2W C8  C14 C 0 1 N N N 74.576 96.294  16.504 4.488  -2.604 -0.260 C8  D2W 18 
D2W O7  O3  O 0 1 N N N 73.353 95.905  15.848 5.442  -1.858 -1.025 O7  D2W 19 
D2W C6  C15 C 0 1 Y N N 72.248 96.679  16.057 5.347  -0.501 -0.966 C6  D2W 20 
D2W C3  C16 C 0 1 Y N N 71.116 96.499  15.288 6.423  0.274  -1.372 C3  D2W 21 
D2W C2  C17 C 0 1 Y N N 70.022 97.319  15.523 6.348  1.654  -1.323 C2  D2W 22 
D2W O10 O4  O 0 1 N N N 73.432 97.778  17.818 3.123  -0.631 -0.099 O10 D2W 23 
D2W C5  C18 C 0 1 Y N N 72.294 97.653  17.055 4.188  0.110  -0.507 C5  D2W 24 
D2W C4  C19 C 0 1 Y N N 71.216 98.482  17.289 4.111  1.505  -0.460 C4  D2W 25 
D2W C1  C20 C 0 1 Y N N 70.073 98.301  16.521 5.200  2.273  -0.872 C1  D2W 26 
D2W C16 C21 C 0 1 Y N N 71.281 99.507  18.372 2.877  2.166  0.026  C16 D2W 27 
D2W N21 N3  N 0 1 Y N N 71.792 99.096  19.593 2.303  1.746  1.148  N21 D2W 28 
D2W C20 C22 C 0 1 Y N N 71.900 99.947  20.657 1.203  2.309  1.614  C20 D2W 29 
D2W O22 O5  O 0 1 N N N 72.450 99.414  21.812 0.650  1.849  2.764  O22 D2W 30 
D2W C23 C23 C 0 1 N N N 73.283 100.174 22.706 1.244  0.690  3.352  C23 D2W 31 
D2W C19 C24 C 0 1 Y N N 71.443 101.295 20.517 0.605  3.367  0.939  C19 D2W 32 
D2W C18 C25 C 0 1 Y N N 70.896 101.733 19.284 1.174  3.832  -0.235 C18 D2W 33 
D2W C17 C26 C 0 1 Y N N 70.818 100.836 18.190 2.332  3.225  -0.695 C17 D2W 34 
D2W H1  H1  H 0 1 N N N 79.610 96.550  19.322 -2.742 -3.744 1.446  H1  D2W 35 
D2W H2  H2  H 0 1 N N N 80.754 94.393  18.937 -4.974 -2.839 0.958  H2  D2W 36 
D2W H3  H3  H 0 1 N N N 78.451 92.023  17.926 -4.979 1.198  -0.970 H3  D2W 37 
D2W H4  H4  H 0 1 N N N 78.842 91.188  16.384 -5.103 0.129  -2.387 H4  D2W 38 
D2W H5  H5  H 0 1 N N N 79.271 90.278  18.997 -7.056 1.604  -2.323 H5  D2W 39 
D2W H6  H6  H 0 1 N N N 79.853 89.549  17.462 -7.573 -0.062 -1.966 H6  D2W 40 
D2W H8  H8  H 0 1 N N N 80.619 91.449  20.375 -7.043 3.255  -0.598 H8  D2W 41 
D2W H9  H9  H 0 1 N N N 82.355 91.727  20.007 -7.313 2.776  1.095  H9  D2W 42 
D2W H10 H10 H 0 1 N N N 81.093 92.688  19.164 -5.819 2.287  0.259  H10 D2W 43 
D2W H11 H11 H 0 1 N N N 83.234 91.105  17.801 -9.469 0.468  -0.665 H11 D2W 44 
D2W H12 H12 H 0 1 N N N 82.235 90.081  16.714 -9.381 1.745  0.572  H12 D2W 45 
D2W H13 H13 H 0 1 N N N 81.902 91.841  16.847 -9.233 2.164  -1.152 H13 D2W 46 
D2W H14 H14 H 0 1 N N N 78.275 93.643  15.534 -3.219 0.202  -1.485 H14 D2W 47 
D2W H15 H15 H 0 1 N N N 77.157 95.809  15.895 -0.982 -0.692 -1.003 H15 D2W 48 
D2W H16 H16 H 0 1 N N N 76.143 98.607  18.495 0.623  -1.460 -0.564 H16 D2W 49 
D2W H17 H17 H 0 1 N N N 75.140 97.046  19.918 2.264  -2.650 1.369  H17 D2W 50 
D2W H18 H18 H 0 1 N N N 75.948 95.719  19.017 2.088  -3.824 0.043  H18 D2W 51 
D2W H19 H19 H 0 1 N N N 73.622 95.794  18.346 2.855  -2.066 -1.570 H19 D2W 52 
D2W H20 H20 H 0 1 N N N 75.304 95.471  16.454 4.734  -2.537 0.800  H20 D2W 53 
D2W H21 H21 H 0 1 N N N 74.995 97.184  16.013 4.499  -3.648 -0.575 H21 D2W 54 
D2W H22 H22 H 0 1 N N N 71.083 95.738  14.522 7.325  -0.202 -1.726 H22 D2W 55 
D2W H23 H23 H 0 1 N N N 69.125 97.200  14.933 7.190  2.251  -1.640 H23 D2W 56 
D2W H24 H24 H 0 1 N N N 69.210 98.927  16.696 5.144  3.351  -0.837 H24 D2W 57 
D2W H25 H25 H 0 1 N N N 73.597 99.537  23.546 1.270  -0.116 2.619  H25 D2W 58 
D2W H26 H26 H 0 1 N N N 74.172 100.531 22.165 2.260  0.925  3.670  H26 D2W 59 
D2W H27 H27 H 0 1 N N N 72.718 101.036 23.090 0.656  0.378  4.215  H27 D2W 60 
D2W H28 H28 H 0 1 N N N 71.514 101.979 21.350 -0.295 3.822  1.326  H28 D2W 61 
D2W H29 H29 H 0 1 N N N 70.540 102.747 19.179 0.728  4.652  -0.777 H29 D2W 62 
D2W H30 H30 H 0 1 N N N 70.416 101.156 17.240 2.803  3.567  -1.605 H30 D2W 63 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
D2W C3  C2  DOUB Y N 1  
D2W C3  C6  SING Y N 2  
D2W C2  C1  SING Y N 3  
D2W O7  C6  SING N N 4  
D2W O7  C8  SING N N 5  
D2W C6  C5  DOUB Y N 6  
D2W C25 C24 DOUB Y N 7  
D2W C25 C26 SING Y N 8  
D2W C8  C9  SING N N 9  
D2W C1  C4  DOUB Y N 10 
D2W C24 C15 SING Y N 11 
D2W O29 C26 SING N N 12 
D2W O29 C30 SING N N 13 
D2W C5  C4  SING Y N 14 
D2W C5  O10 SING N N 15 
D2W C26 C27 DOUB Y N 16 
D2W C4  C16 SING N N 17 
D2W C30 C31 SING N N 18 
D2W C33 N32 SING N N 19 
D2W O14 C13 DOUB N N 20 
D2W C15 C13 SING N N 21 
D2W C15 C28 DOUB Y N 22 
D2W O10 C9  SING N N 23 
D2W C13 N12 SING N N 24 
D2W C9  C11 SING N N 25 
D2W C31 N32 SING N N 26 
D2W C17 C16 DOUB Y N 27 
D2W C17 C18 SING Y N 28 
D2W C27 C28 SING Y N 29 
D2W C16 N21 SING Y N 30 
D2W N12 C11 SING N N 31 
D2W N32 C34 SING N N 32 
D2W C18 C19 DOUB Y N 33 
D2W N21 C20 DOUB Y N 34 
D2W C19 C20 SING Y N 35 
D2W C20 O22 SING N N 36 
D2W O22 C23 SING N N 37 
D2W C28 H1  SING N N 38 
D2W C27 H2  SING N N 39 
D2W C30 H3  SING N N 40 
D2W C30 H4  SING N N 41 
D2W C31 H5  SING N N 42 
D2W C31 H6  SING N N 43 
D2W C34 H8  SING N N 44 
D2W C34 H9  SING N N 45 
D2W C34 H10 SING N N 46 
D2W C33 H11 SING N N 47 
D2W C33 H12 SING N N 48 
D2W C33 H13 SING N N 49 
D2W C25 H14 SING N N 50 
D2W C24 H15 SING N N 51 
D2W N12 H16 SING N N 52 
D2W C11 H17 SING N N 53 
D2W C11 H18 SING N N 54 
D2W C9  H19 SING N N 55 
D2W C8  H20 SING N N 56 
D2W C8  H21 SING N N 57 
D2W C3  H22 SING N N 58 
D2W C2  H23 SING N N 59 
D2W C1  H24 SING N N 60 
D2W C23 H25 SING N N 61 
D2W C23 H26 SING N N 62 
D2W C23 H27 SING N N 63 
D2W C19 H28 SING N N 64 
D2W C18 H29 SING N N 65 
D2W C17 H30 SING N N 66 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
D2W InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C26H29N3O5/c1-29(2)14-15-32-19-12-10-18(11-13-19)26(30)27-16-20-17-33-23-8-4-6-21(25(23)34-20)22-7-5-9-24(28-22)31-3/h4-13,20H,14-17H2,1-3H3,(H,27,30)/t20-/m1/s1" 
D2W InChIKey         InChI                1.03  SEONIINQKDOTIR-HXUWFJFHSA-N                                                                                                                                                  
D2W SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "COc1cccc(n1)c2cccc3OC[C@@H](CNC(=O)c4ccc(OCCN(C)C)cc4)Oc23"                                                                                                                 
D2W SMILES           CACTVS               3.385 "COc1cccc(n1)c2cccc3OC[CH](CNC(=O)c4ccc(OCCN(C)C)cc4)Oc23"                                                                                                                   
D2W SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CN(C)CCOc1ccc(cc1)C(=O)NC[C@@H]2COc3cccc(c3O2)c4cccc(n4)OC"                                                                                                                 
D2W SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CN(C)CCOc1ccc(cc1)C(=O)NCC2COc3cccc(c3O2)c4cccc(n4)OC"                                                                                                                      
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
D2W "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "4-[2-(dimethylamino)ethoxy]-~{N}-[[(3~{R})-5-(6-methoxypyridin-2-yl)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-3-yl]methyl]benzamide" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
D2W "Create component" 2017-12-15 EBI  
D2W "Initial release"  2018-09-05 RCSB 
# 
