data_D2N
# 
_chem_comp.id                                    D2N 
_chem_comp.name                                  "ethyl 6-{3-[(2,4-diamino-5-methylpyrido[2,3-d]pyrimidin-6-yl)methyl]-4-methoxyphenoxy}hexanoate" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C24 H31 N5 O4" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2010-07-29 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2011-06-04 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        453.534 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     D2N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        3NZB 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
D2N N1   N1   N 0 1 Y N N 10.224 -1.751 13.123 5.431   -3.561 0.296  N1   D2N 1  
D2N C2   C2   C 0 1 Y N N 10.547 -2.587 12.124 6.346   -3.036 1.105  C2   D2N 2  
D2N N3   N3   N 0 1 Y N N 11.622 -2.354 11.357 6.516   -1.735 1.247  N3   D2N 3  
D2N C4   C4   C 0 1 Y N N 12.413 -1.295 11.601 5.753   -0.871 0.562  C4   D2N 4  
D2N C5   C5   C 0 1 Y N N 12.121 -0.381 12.606 4.765   -1.386 -0.312 C5   D2N 5  
D2N C6   C6   C 0 1 Y N N 10.986 -0.682 13.404 4.627   -2.791 -0.425 C6   D2N 6  
D2N CAA  CAA  C 0 1 N N N 27.157 -0.312 11.601 -12.064 -1.419 0.942  CAA  D2N 7  
D2N CAB  CAB  C 0 1 N N N 14.102 3.338  10.744 3.014   4.686  1.528  CAB  D2N 8  
D2N CAC  CAC  C 0 1 N N N 12.830 1.799  13.860 2.896   -1.005 -1.975 CAC  D2N 9  
D2N NAD  NAD  N 0 1 N N N 9.779  -3.651 11.817 7.154   -3.891 1.831  NAD  D2N 10 
D2N NAE  NAE  N 0 1 N N N 10.552 0.050  14.445 3.682   -3.344 -1.261 NAE  D2N 11 
D2N OAF  OAF  O 0 1 N N N 25.916 -0.948 9.742  -8.330  -1.661 -0.787 OAF  D2N 12 
D2N CAG  CAG  C 0 1 Y N N 18.139 2.214  8.928  -0.313  2.539  0.527  CAG  D2N 13 
D2N CAH  CAH  C 0 1 Y N N 16.895 2.783  8.704  0.825   3.253  0.848  CAH  D2N 14 
D2N CAI  CAI  C 0 1 Y N N 14.291 -0.118 10.922 5.151   1.287  0.012  CAI  D2N 15 
D2N CAJ  CAJ  C 0 1 Y N N 17.438 1.525  11.143 0.902   1.377  -1.190 CAJ  D2N 16 
D2N CAK  CAK  C 0 1 N N N 25.708 -0.187 12.101 -10.765 -1.662 0.172  CAK  D2N 17 
D2N CAL  CAL  C 0 1 N N N 21.366 -0.955 10.046 -4.978  0.580  0.279  CAL  D2N 18 
D2N CAM  CAM  C 0 1 N N N 20.659 -0.462 8.782  -3.718  0.282  -0.535 CAM  D2N 19 
D2N CAN  CAN  C 0 1 N N N 22.701 -1.587 9.636  -6.125  -0.306 -0.213 CAN  D2N 20 
D2N CAO  CAO  C 0 1 N N N 20.197 0.975  8.936  -2.572  1.168  -0.043 CAO  D2N 21 
D2N CAP  CAP  C 0 1 N N N 23.655 -0.537 9.075  -7.385  -0.008 0.602  CAP  D2N 22 
D2N CAQ  CAQ  C 0 1 N N N 15.096 2.025  12.041 3.323   1.841  -1.617 CAQ  D2N 23 
D2N NAR  NAR  N 0 1 Y N N 13.481 -1.170 10.785 5.904   0.448  0.688  NAR  D2N 24 
D2N OAU  OAU  O 0 1 N N N 14.728 3.286  9.458  3.124   3.733  0.469  OAU  D2N 25 
D2N OAV  OAV  O 0 1 N N N 24.807 0.400  11.127 -9.725  -0.791 0.689  OAV  D2N 26 
D2N OAW  OAW  O 0 1 N N N 19.669 1.065  10.270 -1.394  0.890  -0.804 OAW  D2N 27 
D2N CAX  CAX  C 0 1 N N N 24.868 -0.360 9.994  -8.514  -0.881 0.117  CAX  D2N 28 
D2N CAZ  CAZ  C 0 1 Y N N 18.415 1.590  10.130 -0.276  1.597  -0.491 CAZ  D2N 29 
D2N CBB  CBB  C 0 1 Y N N 12.992 0.710  12.775 3.959   -0.498 -1.035 CBB  D2N 30 
D2N CBC  CBC  C 0 1 Y N N 14.090 0.836  11.917 4.165   0.845  -0.861 CBC  D2N 31 
D2N CBD  CBD  C 0 1 Y N N 16.176 2.093  10.924 2.041   2.088  -0.865 CBD  D2N 32 
D2N CBE  CBE  C 0 1 Y N N 15.932 2.723  9.700  2.004   3.030  0.153  CBE  D2N 33 
D2N HAA  HAA  H 0 1 N N N 27.779 -0.763 12.388 -12.368 -0.380 0.823  HAA  D2N 34 
D2N HAAA HAAA H 0 0 N N N 27.182 -0.949 10.704 -12.845 -2.073 0.554  HAAA D2N 35 
D2N HAAB HAAB H 0 0 N N N 27.546 0.686  11.353 -11.905 -1.633 2.000  HAAB D2N 36 
D2N HAB  HAB  H 0 1 N N N 13.103 3.787  10.648 2.262   5.432  1.269  HAB  D2N 37 
D2N HABA HABA H 0 0 N N N 14.008 2.319  11.147 2.719   4.177  2.445  HABA D2N 38 
D2N HABB HABB H 0 0 N N N 14.714 3.947  11.425 3.976   5.176  1.677  HABB D2N 39 
D2N HAC  HAC  H 0 1 N N N 13.368 1.494  14.770 1.995   -1.243 -1.411 HAC  D2N 40 
D2N HACA HACA H 0 0 N N N 13.244 2.749  13.491 2.670   -0.238 -2.715 HACA D2N 41 
D2N HACB HACB H 0 0 N N N 11.763 1.930  14.092 3.256   -1.902 -2.480 HACB D2N 42 
D2N HNAD HNAD H 0 0 N N N 8.992  -3.683 12.433 7.047   -4.851 1.743  HNAD D2N 43 
D2N HNAA HNAA H 0 0 N N N 9.460  -3.570 10.873 7.828   -3.531 2.428  HNAA D2N 44 
D2N HNAE HNAE H 0 0 N N N 9.719  -0.360 14.817 2.794   -2.957 -1.312 HNAE D2N 45 
D2N HNAB HNAB H 0 0 N N N 11.257 0.073  15.153 3.904   -4.120 -1.798 HNAB D2N 46 
D2N HAG  HAG  H 0 1 N N N 18.896 2.258  8.159  -1.230  2.710  1.071  HAG  D2N 47 
D2N HAH  HAH  H 0 1 N N N 16.678 3.268  7.764  0.796   3.986  1.641  HAH  D2N 48 
D2N HAI  HAI  H 0 1 N N N 15.124 -0.003 10.244 5.302   2.349  0.140  HAI  D2N 49 
D2N HAJ  HAJ  H 0 1 N N N 17.660 1.040  12.082 0.931   0.644  -1.982 HAJ  D2N 50 
D2N HAK  HAK  H 0 1 N N N 25.341 -1.195 12.343 -10.461 -2.702 0.291  HAK  D2N 51 
D2N HAKA HAKA H 0 0 N N N 25.709 0.453  12.996 -10.924 -1.449 -0.885 HAKA D2N 52 
D2N HAL  HAL  H 0 1 N N N 21.546 -0.110 10.727 -4.787  0.375  1.333  HAL  D2N 53 
D2N HALA HALA H 0 0 N N N 20.740 -1.702 10.557 -5.251  1.628  0.156  HALA D2N 54 
D2N HAM  HAM  H 0 1 N N N 21.359 -0.522 7.936  -3.445  -0.766 -0.412 HAM  D2N 55 
D2N HAMA HAMA H 0 0 N N N 19.783 -1.099 8.592  -3.909  0.487  -1.589 HAMA D2N 56 
D2N HAN  HAN  H 0 1 N N N 23.162 -2.053 10.520 -6.316  -0.101 -1.266 HAN  D2N 57 
D2N HANA HANA H 0 0 N N N 22.514 -2.348 8.864  -5.852  -1.354 -0.090 HANA D2N 58 
D2N HAO  HAO  H 0 1 N N N 21.036 1.673  8.799  -2.844  2.216  -0.166 HAO  D2N 59 
D2N HAOA HAOA H 0 0 N N N 19.425 1.220  8.192  -2.380  0.963  1.010  HAOA D2N 60 
D2N HAP  HAP  H 0 1 N N N 24.001 -0.860 8.082  -7.194  -0.213 1.655  HAP  D2N 61 
D2N HAPA HAPA H 0 0 N N N 23.124 0.423  8.992  -7.658  1.040  0.479  HAPA D2N 62 
D2N HAQ  HAQ  H 0 1 N N N 15.618 1.921  13.004 3.872   2.778  -1.717 HAQ  D2N 63 
D2N HAQA HAQA H 0 0 N N N 14.516 2.959  12.001 3.094   1.446  -2.607 HAQA D2N 64 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
D2N C2  N1   DOUB Y N 1  
D2N N1  C6   SING Y N 2  
D2N N3  C2   SING Y N 3  
D2N NAD C2   SING N N 4  
D2N N3  C4   DOUB Y N 5  
D2N NAR C4   SING Y N 6  
D2N C4  C5   SING Y N 7  
D2N C5  CBB  SING Y N 8  
D2N C5  C6   DOUB Y N 9  
D2N C6  NAE  SING N N 10 
D2N CAA CAK  SING N N 11 
D2N CAA HAA  SING N N 12 
D2N CAA HAAA SING N N 13 
D2N CAA HAAB SING N N 14 
D2N OAU CAB  SING N N 15 
D2N CAB HAB  SING N N 16 
D2N CAB HABA SING N N 17 
D2N CAB HABB SING N N 18 
D2N CBB CAC  SING N N 19 
D2N CAC HAC  SING N N 20 
D2N CAC HACA SING N N 21 
D2N CAC HACB SING N N 22 
D2N NAD HNAD SING N N 23 
D2N NAD HNAA SING N N 24 
D2N NAE HNAE SING N N 25 
D2N NAE HNAB SING N N 26 
D2N OAF CAX  DOUB N N 27 
D2N CAH CAG  DOUB Y N 28 
D2N CAG CAZ  SING Y N 29 
D2N CAG HAG  SING N N 30 
D2N CAH CBE  SING Y N 31 
D2N CAH HAH  SING N N 32 
D2N NAR CAI  DOUB Y N 33 
D2N CAI CBC  SING Y N 34 
D2N CAI HAI  SING N N 35 
D2N CAZ CAJ  DOUB Y N 36 
D2N CBD CAJ  SING Y N 37 
D2N CAJ HAJ  SING N N 38 
D2N OAV CAK  SING N N 39 
D2N CAK HAK  SING N N 40 
D2N CAK HAKA SING N N 41 
D2N CAM CAL  SING N N 42 
D2N CAN CAL  SING N N 43 
D2N CAL HAL  SING N N 44 
D2N CAL HALA SING N N 45 
D2N CAM CAO  SING N N 46 
D2N CAM HAM  SING N N 47 
D2N CAM HAMA SING N N 48 
D2N CAP CAN  SING N N 49 
D2N CAN HAN  SING N N 50 
D2N CAN HANA SING N N 51 
D2N CAO OAW  SING N N 52 
D2N CAO HAO  SING N N 53 
D2N CAO HAOA SING N N 54 
D2N CAP CAX  SING N N 55 
D2N CAP HAP  SING N N 56 
D2N CAP HAPA SING N N 57 
D2N CBD CAQ  SING N N 58 
D2N CBC CAQ  SING N N 59 
D2N CAQ HAQ  SING N N 60 
D2N CAQ HAQA SING N N 61 
D2N OAU CBE  SING N N 62 
D2N CAX OAV  SING N N 63 
D2N CAZ OAW  SING N N 64 
D2N CBC CBB  DOUB Y N 65 
D2N CBE CBD  DOUB Y N 66 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
D2N SMILES           ACDLabs              12.01 "O=C(OCC)CCCCCOc1cc(c(OC)cc1)Cc2c(c3c(nc2)nc(nc3N)N)C"                                                                                                                       
D2N SMILES_CANONICAL CACTVS               3.370 "CCOC(=O)CCCCCOc1ccc(OC)c(Cc2cnc3nc(N)nc(N)c3c2C)c1"                                                                                                                         
D2N SMILES           CACTVS               3.370 "CCOC(=O)CCCCCOc1ccc(OC)c(Cc2cnc3nc(N)nc(N)c3c2C)c1"                                                                                                                         
D2N SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.7.0 "CCOC(=O)CCCCCOc1ccc(c(c1)Cc2cnc3c(c2C)c(nc(n3)N)N)OC"                                                                                                                       
D2N SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.7.0 "CCOC(=O)CCCCCOc1ccc(c(c1)Cc2cnc3c(c2C)c(nc(n3)N)N)OC"                                                                                                                       
D2N InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C24H31N5O4/c1-4-32-20(30)8-6-5-7-11-33-18-9-10-19(31-3)16(13-18)12-17-14-27-23-21(15(17)2)22(25)28-24(26)29-23/h9-10,13-14H,4-8,11-12H2,1-3H3,(H4,25,26,27,28,29)" 
D2N InChIKey         InChI                1.03  FGBRLIYQKRWOSO-UHFFFAOYSA-N                                                                                                                                                  
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
D2N "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "ethyl 6-{3-[(2,4-diamino-5-methylpyrido[2,3-d]pyrimidin-6-yl)methyl]-4-methoxyphenoxy}hexanoate"       
D2N "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.7.0 "ethyl 6-[3-[[2,4-bis(azanyl)-5-methyl-pyrido[2,3-d]pyrimidin-6-yl]methyl]-4-methoxy-phenoxy]hexanoate" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
D2N "Create component"     2010-07-29 RCSB 
D2N "Modify aromatic_flag" 2011-06-04 RCSB 
D2N "Modify descriptor"    2011-06-04 RCSB 
# 
