data_VED
#

_chem_comp.id                                   VED
_chem_comp.name                                 "3-[3-(carboxymethyl)-6-(3-methoxyphenyl)-1-benzofuran-2-yl]benzoic acid"
_chem_comp.type                                 non-polymer
_chem_comp.pdbx_type                            HETAIN
_chem_comp.formula                              "C24 H18 O6"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id              ?
_chem_comp.pdbx_synonyms                        ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge                   0
_chem_comp.pdbx_initial_date                    2020-08-04
_chem_comp.pdbx_modified_date                   2021-08-06
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                  N
_chem_comp.pdbx_release_status                  REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by                     ?
_chem_comp.pdbx_replaces                        ?
_chem_comp.formula_weight                       402.396
_chem_comp.one_letter_code                      ?
_chem_comp.three_letter_code                    VED
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details       ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag  N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details       Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag  N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code       6XT3
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list               ?
_chem_comp.pdbx_processing_site                 RCSB
#   #
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
VED  C10   C1   C  0  1  Y  N  N  21.693   -5.492   0.751  -5.138   1.281   0.040  C10   VED   1  
VED  C17   C2   C  0  1  Y  N  N  19.419  -11.471   4.263   1.760   0.853   0.320  C17   VED   2  
VED  C20   C3   C  0  1  Y  N  N  17.497  -14.646   5.238   5.331  -0.233  -0.044  C20   VED   3  
VED  C21   C4   C  0  1  Y  N  N  17.282  -15.599   6.243   6.598   0.318  -0.143  C21   VED   4  
VED  C24   C5   C  0  1  Y  N  N  17.770  -15.366   7.537   6.760   1.696  -0.113  C24   VED   5  
VED  C26   C6   C  0  1  Y  N  N  18.655  -13.226   6.743   4.393   1.983   0.114  C26   VED   6  
VED  C28   C7   C  0  1  Y  N  N  17.686  -11.534   2.078   1.452  -1.920   0.258  C28   VED   7  
VED  C02   C8   C  0  1  N  N  N  17.244   -8.408  -0.151  -2.262  -3.011  -0.878  C02   VED   8  
VED  C03   C9   C  0  1  N  N  N  18.650   -9.099  -0.151  -1.799  -2.670   0.515  C03   VED   9  
VED  C04   C10  C  0  1  Y  N  N  19.181   -9.522   1.170  -1.104  -1.333   0.500  C04   VED  10  
VED  C05   C11  C  0  1  Y  N  N  20.268   -8.958   1.788  -1.684  -0.112   0.592  C05   VED  11  
VED  C06   C12  C  0  1  Y  N  N  21.219   -7.842   1.437  -3.136   0.130   0.728  C06   VED  12  
VED  C07   C13  C  0  1  Y  N  N  22.612   -8.058   1.437  -3.877  -0.571   1.683  C07   VED  13  
VED  C08   C14  C  0  1  Y  N  N  23.515   -7.037   1.111  -5.233  -0.346   1.811  C08   VED  14  
VED  C09   C15  C  0  1  Y  N  N  23.065   -5.756   0.767  -5.866   0.573   0.998  C09   VED  15  
VED  C11   C16  C  0  1  N  N  N  21.191   -4.060   0.366  -5.817   2.269  -0.825  C11   VED  16  
VED  C14   C17  C  0  1  Y  N  N  20.809   -6.541   1.082  -3.769   1.059  -0.095  C14   VED  17  
VED  C16   C18  C  0  1  Y  N  N  19.551  -10.584   3.169   0.489   0.308   0.414  C16   VED  18  
VED  C18   C19  C  0  1  Y  N  N  18.385  -12.426   4.286   2.863   0.016   0.191  C18   VED  19  
VED  C19   C20  C  0  1  Y  N  N  18.176  -13.432   5.422   4.222   0.599   0.085  C19   VED  20  
VED  C23   C21  C  0  1  N  N  N  17.138  -17.620   4.916   8.959   0.146  -0.366  C23   VED  21  
VED  C25   C22  C  0  1  Y  N  N  18.456  -14.166   7.771   5.659   2.523   0.015  C25   VED  22  
VED  C27   C23  C  0  1  Y  N  N  17.536  -12.418   3.146   2.698  -1.372   0.162  C27   VED  23  
VED  C29   C24  C  0  1  Y  N  N  18.700  -10.578   2.042   0.335  -1.091   0.377  C29   VED  24  
VED  O01   O1   O  0  1  N  N  N  16.432   -8.761  -1.057  -2.049  -2.247  -1.790  O01   VED  25  
VED  O12   O2   O  0  1  N  N  N  20.256   -3.968  -0.476  -5.182   2.884  -1.658  O12   VED  26  
VED  O13   O3   O  0  1  N  N  N  21.715   -3.062   0.890  -7.139   2.486  -0.690  O13   VED  27  
VED  O15   O4   O  0  1  Y  N  N  20.516   -9.593   3.020  -0.740   0.848   0.543  O15   VED  28  
VED  O22   O5   O  0  1  N  N  N  16.594  -16.767   5.936   7.683  -0.491  -0.269  O22   VED  29  
VED  O30   O6   O  0  1  N  N  N  16.988   -7.562   0.709  -2.911  -4.164  -1.106  O30   VED  30  
VED  H171  H1   H  0  0  N  N  N  20.116  -11.415   5.086   1.892   1.925   0.342  H171  VED  31  
VED  H201  H2   H  0  0  N  N  N  17.113  -14.861   4.252   5.203  -1.305  -0.071  H201  VED  32  
VED  H241  H3   H  0  0  N  N  N  17.622  -16.087   8.327   7.749   2.124  -0.190  H241  VED  33  
VED  H261  H4   H  0  0  N  N  N  19.191  -12.315   6.967   3.536   2.631   0.215  H261  VED  34  
VED  H281  H5   H  0  0  N  N  N  16.994  -11.592   1.251   1.330  -2.993   0.235  H281  VED  35  
VED  H032  H6   H  0  0  N  N  N  18.582   -9.995  -0.786  -2.660  -2.624   1.183  H032  VED  36  
VED  H031  H7   H  0  0  N  N  N  19.370   -8.392  -0.590  -1.108  -3.435   0.866  H031  VED  37  
VED  H071  H8   H  0  0  N  N  N  22.993   -9.035   1.695  -3.387  -1.291   2.322  H071  VED  38  
VED  H081  H9   H  0  0  N  N  N  24.575   -7.241   1.125  -5.800  -0.891   2.551  H081  VED  39  
VED  H091  H10  H  0  0  N  N  N  23.772   -4.979   0.516  -6.927   0.744   1.104  H091  VED  40  
VED  H141  H11  H  0  0  N  N  N  19.749   -6.333   1.062  -3.201   1.603  -0.835  H141  VED  41  
VED  H233  H12  H  0  0  N  N  N  16.488  -18.498   4.786   8.975   0.796  -1.241  H233  VED  42  
VED  H231  H13  H  0  0  N  N  N  17.198  -17.065   3.968   9.138   0.739   0.530  H231  VED  43  
VED  H232  H14  H  0  0  N  N  N  18.145  -17.950   5.212   9.736  -0.612  -0.462  H232  VED  44  
VED  H251  H15  H  0  0  N  N  N  18.839  -13.959   8.759   5.791   3.595   0.039  H251  VED  45  
VED  H271  H16  H  0  0  N  N  N  16.730  -13.136   3.105   3.562  -2.014   0.070  H271  VED  46  
VED  H1    H17  H  0  1  N  N  N  21.302   -2.275   0.555  -7.539   3.142  -1.278  H1    VED  47  
VED  H2    H18  H  0  1  N  N  N  16.106   -7.233   0.578  -3.188  -4.339  -2.016  H2    VED  48  
#   #
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
VED  O01  C02   DOUB  N  N   1  
VED  O12  C11   DOUB  N  N   2  
VED  C03  C02   SING  N  N   3  
VED  C03  C04   SING  N  N   4  
VED  C02  O30   SING  N  N   5  
VED  C11  C10   SING  N  N   6  
VED  C11  O13   SING  N  N   7  
VED  C10  C09   DOUB  Y  N   8  
VED  C10  C14   SING  Y  N   9  
VED  C09  C08   SING  Y  N  10  
VED  C14  C06   DOUB  Y  N  11  
VED  C08  C07   DOUB  Y  N  12  
VED  C04  C05   DOUB  Y  N  13  
VED  C04  C29   SING  Y  N  14  
VED  C07  C06   SING  Y  N  15  
VED  C06  C05   SING  N  N  16  
VED  C05  O15   SING  Y  N  17  
VED  C29  C28   DOUB  Y  N  18  
VED  C29  C16   SING  Y  N  19  
VED  C28  C27   SING  Y  N  20  
VED  O15  C16   SING  Y  N  21  
VED  C27  C18   DOUB  Y  N  22  
VED  C16  C17   DOUB  Y  N  23  
VED  C17  C18   SING  Y  N  24  
VED  C18  C19   SING  N  N  25  
VED  C23  O22   SING  N  N  26  
VED  C20  C19   DOUB  Y  N  27  
VED  C20  C21   SING  Y  N  28  
VED  C19  C26   SING  Y  N  29  
VED  O22  C21   SING  N  N  30  
VED  C21  C24   DOUB  Y  N  31  
VED  C26  C25   DOUB  Y  N  32  
VED  C24  C25   SING  Y  N  33  
VED  C17  H171  SING  N  N  34  
VED  C20  H201  SING  N  N  35  
VED  C24  H241  SING  N  N  36  
VED  C26  H261  SING  N  N  37  
VED  C28  H281  SING  N  N  38  
VED  C03  H032  SING  N  N  39  
VED  C03  H031  SING  N  N  40  
VED  C07  H071  SING  N  N  41  
VED  C08  H081  SING  N  N  42  
VED  C09  H091  SING  N  N  43  
VED  C14  H141  SING  N  N  44  
VED  C23  H233  SING  N  N  45  
VED  C23  H231  SING  N  N  46  
VED  C23  H232  SING  N  N  47  
VED  C25  H251  SING  N  N  48  
VED  C27  H271  SING  N  N  49  
VED  O13  H1    SING  N  N  50  
VED  O30  H2    SING  N  N  51  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
VED  SMILES            ACDLabs               12.01  "c4(cccc(c2c(CC(O)=O)c1ccc(cc1o2)c3cc(ccc3)OC)c4)C(O)=O"  
VED  InChI             InChI                 1.03   "InChI=1S/C24H18O6/c1-29-18-7-3-4-14(11-18)15-8-9-19-20(13-22(25)26)23(30-21(19)12-15)16-5-2-6-17(10-16)24(27)28/h2-12H,13H2,1H3,(H,25,26)(H,27,28)"  
VED  InChIKey          InChI                 1.03   OXXURMYRXBYXOG-UHFFFAOYSA-N  
VED  SMILES_CANONICAL  CACTVS                3.385  "COc1cccc(c1)c2ccc3c(CC(O)=O)c(oc3c2)c4cccc(c4)C(O)=O"  
VED  SMILES            CACTVS                3.385  "COc1cccc(c1)c2ccc3c(CC(O)=O)c(oc3c2)c4cccc(c4)C(O)=O"  
VED  SMILES_CANONICAL  "OpenEye OEToolkits"  2.0.7  "COc1cccc(c1)c2ccc3c(c2)oc(c3CC(=O)O)c4cccc(c4)C(=O)O"  
VED  SMILES            "OpenEye OEToolkits"  2.0.7  "COc1cccc(c1)c2ccc3c(c2)oc(c3CC(=O)O)c4cccc(c4)C(=O)O"  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
VED  "SYSTEMATIC NAME"  ACDLabs               12.01  "3-[3-(carboxymethyl)-6-(3-methoxyphenyl)-1-benzofuran-2-yl]benzoic acid"  
VED  "SYSTEMATIC NAME"  "OpenEye OEToolkits"  2.0.7  "3-[3-(2-hydroxy-2-oxoethyl)-6-(3-methoxyphenyl)-1-benzofuran-2-yl]benzoic acid"  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
VED  "Create component"  2020-08-04  RCSB  
VED  "Initial release"   2021-08-11  RCSB  
##
