data_9AB
# 
_chem_comp.id                                    9AB 
_chem_comp.name                                  "8-[4,5,6,7-tetrakis(bromanyl)benzimidazol-1-yl]octanoic acid" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C15 H16 Br4 N2 O2" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2017-05-03 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2024-09-27 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        575.916 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     9AB 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   Y 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        5NUY 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  EBI 
_chem_comp.pdbx_pcm                              Y 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
9AB CBA C1  C  0 1 Y N N N N N -27.368 13.693 73.250 0.207   3.228  -1.058 CBA 9AB 1  
9AB CBD C2  C  0 1 N N N N N N -26.467 14.486 68.942 -4.970  0.930  0.055  CBD 9AB 2  
9AB CBE C3  C  0 1 N N N N N N -25.267 13.671 68.425 -6.354  0.573  -0.491 CBE 9AB 3  
9AB CBF C4  C  0 1 N N N N N N -26.150 14.814 70.429 -3.991  1.103  -1.108 CBF 9AB 4  
9AB CBG C5  C  0 1 N N N N N N -25.327 13.081 66.998 -7.332  0.400  0.672  CBG 9AB 5  
9AB CBI C6  C  0 1 N N N N N N -27.165 15.773 71.078 -2.608  1.461  -0.561 CBI 9AB 6  
9AB CBJ C7  C  0 1 N N N N N N -23.942 12.419 66.840 -8.716  0.043  0.125  CBJ 9AB 7  
9AB CBL C8  C  0 1 N N N N N N -26.928 16.080 72.591 -1.629  1.633  -1.724 CBL 9AB 8  
9AB CCH C9  C  0 1 N N N N N N -23.685 11.518 65.613 -9.680  -0.127 1.271  CCH 9AB 9  
9AB CCO C10 C  0 1 Y N N N N N -27.824 14.563 77.622 2.943   -0.131 0.235  CCO 9AB 10 
9AB CCP C11 C  0 1 Y N N N N N -27.557 15.852 77.194 1.858   -0.900 -0.168 CCP 9AB 11 
9AB CCQ C12 C  0 1 Y N N N N N -27.858 13.562 76.678 2.898   1.242  0.145  CCQ 9AB 12 
9AB CCR C13 C  0 1 Y N N N N N -27.334 16.083 75.829 0.720   -0.298 -0.664 CCR 9AB 13 
9AB CCS C14 C  0 1 Y N N N N N -27.641 13.820 75.385 1.751   1.868  -0.356 CCS 9AB 14 
9AB CCT C15 C  0 1 Y N N N N N -27.378 15.061 74.938 0.658   1.087  -0.762 CCT 9AB 15 
9AB NBS N1  N  0 1 Y N N N N N -27.631 12.990 74.344 1.409   3.166  -0.563 NBS 9AB 16 
9AB NDB N2  N  0 1 Y N N N N N -27.180 14.964 73.596 -0.304  1.975  -1.201 NDB 9AB 17 
9AB OAI O1  O  0 1 N N N N N N -24.537 11.284 64.756 -9.300  0.023  2.408  OAI 9AB 18 
9AB BR2 BR1 BR 0 0 N N N N N N -28.176 14.098 79.449 4.492   -0.977 0.912  BR2 9AB 19 
9AB BR3 BR2 BR 0 0 N N N N N N -27.491 17.268 78.472 1.941   -2.785 -0.035 BR3 9AB 20 
9AB BR1 BR3 BR 0 0 N N N N N N -28.229 11.827 77.299 4.380   2.279  0.697  BR1 9AB 21 
9AB BR4 BR4 BR 0 0 N N N N N N -26.974 17.895 75.301 -0.751  -1.354 -1.208 BR4 9AB 22 
9AB H1  H1  H  0 1 N N N N N N -27.315 13.299 72.246 -0.311  4.141  -1.312 H1  9AB 23 
9AB H2  H2  H  0 1 N N N N N N -26.579 15.413 68.361 -5.032  1.861  0.619  H2  9AB 24 
9AB H3  H3  H  0 1 N N N N N N -27.391 13.894 68.869 -4.620  0.132  0.709  H3  9AB 25 
9AB H4  H4  H  0 1 N N N N N N -25.126 12.828 69.118 -6.704  1.372  -1.145 H4  9AB 26 
9AB H5  H5  H  0 1 N N N N N N -24.387 14.330 68.466 -6.292  -0.358 -1.055 H5  9AB 27 
9AB H6  H6  H  0 1 N N N N N N -26.146 13.874 70.999 -3.930  0.172  -1.672 H6  9AB 28 
9AB H7  H7  H  0 1 N N N N N N -25.153 15.277 70.478 -4.341  1.902  -1.762 H7  9AB 29 
9AB H8  H8  H  0 1 N N N N N N -25.475 13.872 66.248 -6.983  -0.398 1.326  H8  9AB 30 
9AB H9  H9  H  0 1 N N N N N N -26.133 12.338 66.911 -7.394  1.331  1.236  H9  9AB 31 
9AB H10 H10 H  0 1 N N N N N N -27.130 16.726 70.529 -2.669  2.391  0.003  H10 9AB 32 
9AB H11 H11 H  0 1 N N N N N N -28.166 15.328 70.975 -2.258  0.662  0.093  H11 9AB 33 
9AB H12 H12 H  0 1 N N N N N N -23.774 11.802 67.735 -9.066  0.842  -0.528 H12 9AB 34 
9AB H13 H13 H  0 1 N N N N N N -23.198 13.229 66.808 -8.655  -0.888 -0.439 H13 9AB 35 
9AB H14 H14 H  0 1 N N N N N N -25.878 16.388 72.701 -1.567  0.702  -2.289 H14 9AB 36 
9AB H15 H15 H  0 1 N N N N N N -27.587 16.918 72.862 -1.979  2.432  -2.378 H15 9AB 37 
9AB OXT OXT O  0 1 N Y N N N N ?       ?      ?      -10.962 -0.445 1.028  OXT 9AB 38 
9AB H16 H16 H  0 1 N N N N N N ?       ?      ?      -11.542 -0.543 1.795  H16 9AB 39 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
9AB OAI CCH DOUB N N 1  
9AB CCH CBJ SING N N 2  
9AB CBJ CBG SING N N 3  
9AB CBG CBE SING N N 4  
9AB CBE CBD SING N N 5  
9AB CBD CBF SING N N 6  
9AB CBF CBI SING N N 7  
9AB CBI CBL SING N N 8  
9AB CBL NDB SING N N 9  
9AB CBA NDB SING Y N 10 
9AB CBA NBS DOUB Y N 11 
9AB NDB CCT SING Y N 12 
9AB NBS CCS SING Y N 13 
9AB CCT CCS DOUB Y N 14 
9AB CCT CCR SING Y N 15 
9AB BR4 CCR SING N N 16 
9AB CCS CCQ SING Y N 17 
9AB CCR CCP DOUB Y N 18 
9AB CCQ BR1 SING N N 19 
9AB CCQ CCO DOUB Y N 20 
9AB CCP CCO SING Y N 21 
9AB CCP BR3 SING N N 22 
9AB CCO BR2 SING N N 23 
9AB CBA H1  SING N N 24 
9AB CBD H2  SING N N 25 
9AB CBD H3  SING N N 26 
9AB CBE H4  SING N N 27 
9AB CBE H5  SING N N 28 
9AB CBF H6  SING N N 29 
9AB CBF H7  SING N N 30 
9AB CBG H8  SING N N 31 
9AB CBG H9  SING N N 32 
9AB CBI H10 SING N N 33 
9AB CBI H11 SING N N 34 
9AB CBJ H12 SING N N 35 
9AB CBJ H13 SING N N 36 
9AB CBL H14 SING N N 37 
9AB CBL H15 SING N N 38 
9AB CCH OXT SING N N 39 
9AB OXT H16 SING N N 40 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
9AB InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C15H16Br4N2O2/c16-10-11(17)13(19)15-14(12(10)18)20-8-21(15)7-5-3-1-2-4-6-9(22)23/h8H,1-7H2,(H,22,23)" 
9AB InChIKey         InChI                1.03  OTAXRRBXSSWBKI-UHFFFAOYSA-N                                                                                     
9AB SMILES_CANONICAL CACTVS               3.385 "OC(=O)CCCCCCCn1cnc2c(Br)c(Br)c(Br)c(Br)c12"                                                                    
9AB SMILES           CACTVS               3.385 "OC(=O)CCCCCCCn1cnc2c(Br)c(Br)c(Br)c(Br)c12"                                                                    
9AB SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "c1nc2c(n1CCCCCCCC(=O)O)c(c(c(c2Br)Br)Br)Br"                                                                    
9AB SMILES           "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "c1nc2c(n1CCCCCCCC(=O)O)c(c(c(c2Br)Br)Br)Br"                                                                    
# 
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id           9AB 
_pdbx_chem_comp_identifier.type              "SYSTEMATIC NAME" 
_pdbx_chem_comp_identifier.program           "OpenEye OEToolkits" 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version   2.0.6 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier        "8-[4,5,6,7-tetrakis(bromanyl)benzimidazol-1-yl]octanoic acid" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
9AB "Create component"   2017-05-03 RCSB 
9AB "Other modification" 2017-08-03 EBI  
9AB "Initial release"    2020-01-29 RCSB 
9AB "Modify PCM"         2024-09-27 PDBE 
# 
_pdbx_chem_comp_pcm.pcm_id                             1 
_pdbx_chem_comp_pcm.comp_id                            9AB 
_pdbx_chem_comp_pcm.modified_residue_id                DAS 
_pdbx_chem_comp_pcm.type                               None 
_pdbx_chem_comp_pcm.category                           "Covalent chemical modification" 
_pdbx_chem_comp_pcm.position                           "Amino-acid backbone" 
_pdbx_chem_comp_pcm.polypeptide_position               N-terminal 
_pdbx_chem_comp_pcm.comp_id_linking_atom               CCH 
_pdbx_chem_comp_pcm.modified_residue_id_linking_atom   N 
_pdbx_chem_comp_pcm.uniprot_specific_ptm_accession     ? 
_pdbx_chem_comp_pcm.uniprot_generic_ptm_accession      ? 
# 
