data_Q13
# 
_chem_comp.id                                    Q13 
_chem_comp.name                                  "6,6'-{[(2S,3S)-2-aminobutane-1,3-diyl]bis(oxymethanediyl)}bis(4-methylpyridin-2-amine)" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C18 H27 N5 O2" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2013-04-25 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2013-09-13 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        345.439 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     Q13 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        4K5G 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
Q13 N22 N22 N 0 1 N N N 5.365  8.026  26.988 7.137  1.722  -1.191 N22 Q13 1  
Q13 C22 C22 C 0 1 Y N N 4.626  6.877  27.157 5.997  1.319  -0.506 C22 Q13 2  
Q13 C23 C23 C 0 1 Y N N 3.267  6.940  27.511 5.654  1.944  0.688  C23 Q13 3  
Q13 C24 C24 C 0 1 Y N N 2.523  5.758  27.677 4.515  1.535  1.359  C24 Q13 4  
Q13 C27 C27 C 0 1 N N N 1.060  5.822  28.056 4.109  2.186  2.656  C27 Q13 5  
Q13 C25 C25 C 0 1 Y N N 3.143  4.515  27.494 3.756  0.510  0.811  C25 Q13 6  
Q13 N21 N21 N 0 1 Y N N 5.187  5.640  26.989 5.243  0.349  -0.999 N21 Q13 7  
Q13 C26 C26 C 0 1 Y N N 4.498  4.469  27.152 4.155  -0.066 -0.379 C26 Q13 8  
Q13 C16 C16 C 0 1 N N N 5.192  3.126  26.948 3.332  -1.175 -0.982 C16 Q13 9  
Q13 O15 O15 O 0 1 N N N 5.863  3.145  25.676 2.212  -1.450 -0.138 O15 Q13 10 
Q13 C13 C13 C 0 1 N N S 6.353  1.884  25.195 1.362  -2.491 -0.621 C13 Q13 11 
Q13 C14 C14 C 0 1 N N N 5.302  1.220  24.296 1.841  -3.837 -0.072 C14 Q13 12 
Q13 C11 C11 C 0 1 N N S 7.683  2.151  24.475 -0.074 -2.234 -0.159 C11 Q13 13 
Q13 N12 N12 N 0 1 N N N 8.483  3.042  25.318 -0.118 -2.208 1.310  N12 Q13 14 
Q13 C10 C10 C 0 1 N N N 8.504  0.894  24.185 -0.553 -0.889 -0.707 C10 Q13 15 
Q13 O09 O09 O 0 1 N N N 9.783  1.258  23.612 -1.930 -0.701 -0.374 O09 Q13 16 
Q13 C08 C08 C 0 1 N N N 10.927 0.862  24.338 -2.479 0.532  -0.843 C08 Q13 17 
Q13 C06 C06 C 0 1 Y N N 12.265 0.982  23.553 -3.927 0.623  -0.437 C06 Q13 18 
Q13 N01 N01 N 0 1 Y N N 13.271 0.141  23.912 -4.631 1.689  -0.770 N01 Q13 19 
Q13 C02 C02 C 0 1 Y N N 14.488 0.150  23.334 -5.906 1.812  -0.435 C02 Q13 20 
Q13 N02 N02 N 0 1 N N N 15.393 -0.757 23.793 -6.609 2.951  -0.808 N02 Q13 21 
Q13 C03 C03 C 0 1 Y N N 14.757 1.041  22.279 -6.548 0.810  0.286  C03 Q13 22 
Q13 C04 C04 C 0 1 Y N N 13.756 1.933  21.859 -5.836 -0.319 0.649  C04 Q13 23 
Q13 C05 C05 C 0 1 Y N N 12.497 1.893  22.496 -4.502 -0.411 0.274  C05 Q13 24 
Q13 C07 C07 C 0 1 N N N 14.001 2.901  20.706 -6.495 -1.427 1.430  C07 Q13 25 
Q13 H1  H1  H 0 1 N N N 6.304  7.786  26.741 7.690  2.435  -0.835 H1  Q13 26 
Q13 H2  H2  H 0 1 N N N 4.960  8.579  26.260 7.383  1.286  -2.022 H2  Q13 27 
Q13 H3  H3  H 0 1 N N N 2.793  7.899  27.656 6.268  2.738  1.087  H3  Q13 28 
Q13 H4  H4  H 0 1 N N N 0.964  5.817  29.152 3.455  3.033  2.447  H4  Q13 29 
Q13 H5  H5  H 0 1 N N N 0.617  6.745  27.653 3.579  1.462  3.276  H5  Q13 30 
Q13 H6  H6  H 0 1 N N N 0.535  4.950  27.638 4.997  2.534  3.182  H6  Q13 31 
Q13 H7  H7  H 0 1 N N N 2.580  3.601  27.616 2.862  0.166  1.310  H7  Q13 32 
Q13 H8  H8  H 0 1 N N N 4.446  2.318  26.962 2.978  -0.870 -1.967 H8  Q13 33 
Q13 H9  H9  H 0 1 N N N 5.925  2.962  27.751 3.944  -2.072 -1.077 H9  Q13 34 
Q13 H10 H10 H 0 1 N N N 6.550  1.216  26.047 1.394  -2.511 -1.710 H10 Q13 35 
Q13 H11 H11 H 0 1 N N N 4.378  1.057  24.870 2.864  -4.020 -0.402 H11 Q13 36 
Q13 H12 H12 H 0 1 N N N 5.090  1.873  23.437 1.808  -3.817 1.017  H12 Q13 37 
Q13 H13 H13 H 0 1 N N N 5.685  0.254  23.936 1.192  -4.631 -0.441 H13 Q13 38 
Q13 H14 H14 H 0 1 N N N 7.466  2.652  23.520 -0.722 -3.029 -0.527 H14 Q13 39 
Q13 H15 H15 H 0 1 N N N 7.960  3.871  25.518 0.132  -3.106 1.695  H15 Q13 40 
Q13 H16 H16 H 0 1 N N N 8.710  2.577  26.174 0.476  -1.479 1.676  H16 Q13 41 
Q13 H18 H18 H 0 1 N N N 7.956  0.256  23.476 0.040  -0.086 -0.269 H18 Q13 42 
Q13 H19 H19 H 0 1 N N N 8.669  0.342  25.122 -0.437 -0.876 -1.791 H19 Q13 43 
Q13 H20 H20 H 0 1 N N N 10.797 -0.189 24.637 -1.926 1.365  -0.407 H20 Q13 44 
Q13 H21 H21 H 0 1 N N N 10.999 1.492  25.237 -2.403 0.574  -1.929 H21 Q13 45 
Q13 H22 H22 H 0 1 N N N 14.978 -1.304 24.520 -6.166 3.652  -1.310 H22 Q13 46 
Q13 H23 H23 H 0 1 N N N 15.674 -1.356 23.043 -7.544 3.045  -0.564 H23 Q13 47 
Q13 H24 H24 H 0 1 N N N 15.723 1.039  21.797 -7.588 0.912  0.558  H24 Q13 48 
Q13 H25 H25 H 0 1 N N N 11.709 2.559  22.176 -3.919 -1.279 0.542  H25 Q13 49 
Q13 H26 H26 H 0 1 N N N 13.726 2.418  19.757 -6.928 -2.150 0.740  H26 Q13 50 
Q13 H27 H27 H 0 1 N N N 13.389 3.804  20.849 -5.752 -1.922 2.056  H27 Q13 51 
Q13 H28 H28 H 0 1 N N N 15.065 3.179  20.681 -7.280 -1.010 2.060  H28 Q13 52 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
Q13 C07 C04 SING N N 1  
Q13 C04 C03 DOUB Y N 2  
Q13 C04 C05 SING Y N 3  
Q13 C03 C02 SING Y N 4  
Q13 C05 C06 DOUB Y N 5  
Q13 C02 N02 SING N N 6  
Q13 C02 N01 DOUB Y N 7  
Q13 C06 N01 SING Y N 8  
Q13 C06 C08 SING N N 9  
Q13 O09 C10 SING N N 10 
Q13 O09 C08 SING N N 11 
Q13 C10 C11 SING N N 12 
Q13 C14 C13 SING N N 13 
Q13 C11 C13 SING N N 14 
Q13 C11 N12 SING N N 15 
Q13 C13 O15 SING N N 16 
Q13 O15 C16 SING N N 17 
Q13 C16 C26 SING N N 18 
Q13 N22 C22 SING N N 19 
Q13 N21 C26 DOUB Y N 20 
Q13 N21 C22 SING Y N 21 
Q13 C26 C25 SING Y N 22 
Q13 C22 C23 DOUB Y N 23 
Q13 C25 C24 DOUB Y N 24 
Q13 C23 C24 SING Y N 25 
Q13 C24 C27 SING N N 26 
Q13 N22 H1  SING N N 27 
Q13 N22 H2  SING N N 28 
Q13 C23 H3  SING N N 29 
Q13 C27 H4  SING N N 30 
Q13 C27 H5  SING N N 31 
Q13 C27 H6  SING N N 32 
Q13 C25 H7  SING N N 33 
Q13 C16 H8  SING N N 34 
Q13 C16 H9  SING N N 35 
Q13 C13 H10 SING N N 36 
Q13 C14 H11 SING N N 37 
Q13 C14 H12 SING N N 38 
Q13 C14 H13 SING N N 39 
Q13 C11 H14 SING N N 40 
Q13 N12 H15 SING N N 41 
Q13 N12 H16 SING N N 42 
Q13 C10 H18 SING N N 43 
Q13 C10 H19 SING N N 44 
Q13 C08 H20 SING N N 45 
Q13 C08 H21 SING N N 46 
Q13 N02 H22 SING N N 47 
Q13 N02 H23 SING N N 48 
Q13 C03 H24 SING N N 49 
Q13 C05 H25 SING N N 50 
Q13 C07 H26 SING N N 51 
Q13 C07 H27 SING N N 52 
Q13 C07 H28 SING N N 53 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
Q13 SMILES           ACDLabs              12.01 "n1c(N)cc(cc1COCC(N)C(OCc2nc(N)cc(c2)C)C)C"                                                                                                                    
Q13 InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C18H27N5O2/c1-11-4-14(22-17(20)6-11)8-24-10-16(19)13(3)25-9-15-5-12(2)7-18(21)23-15/h4-7,13,16H,8-10,19H2,1-3H3,(H2,20,22)(H2,21,23)/t13-,16-/m0/s1" 
Q13 InChIKey         InChI                1.03  BGQWILAWEWZMTG-BBRMVZONSA-N                                                                                                                                    
Q13 SMILES_CANONICAL CACTVS               3.370 "C[C@H](OCc1cc(C)cc(N)n1)[C@@H](N)COCc2cc(C)cc(N)n2"                                                                                                           
Q13 SMILES           CACTVS               3.370 "C[CH](OCc1cc(C)cc(N)n1)[CH](N)COCc2cc(C)cc(N)n2"                                                                                                              
Q13 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "Cc1cc(nc(c1)N)COC[C@@H]([C@H](C)OCc2cc(cc(n2)N)C)N"                                                                                                           
Q13 SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "Cc1cc(nc(c1)N)COCC(C(C)OCc2cc(cc(n2)N)C)N"                                                                                                                    
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
Q13 "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              12.01 "6,6'-{[(2S,3S)-2-aminobutane-1,3-diyl]bis(oxymethanediyl)}bis(4-methylpyridin-2-amine)"                  
Q13 "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "6-[[(2S,3S)-2-azanyl-3-[(6-azanyl-4-methyl-pyridin-2-yl)methoxy]butoxy]methyl]-4-methyl-pyridin-2-amine" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
Q13 "Create component" 2013-04-25 RCSB 
Q13 "Initial release"  2013-09-18 RCSB 
# 
